Genetic diversity of the pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) population in the Brazilian Pantanal assessed by combining fresh fecal DNA analysis and a set of heterologous microsatellite loci

Abstract The pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) is close to being classified as 'globally threatened', with the largest population occurring in the Brazilian Pantanal. Since capture is stressful to these animals, non-invasive sampling methods such as the use of feces can provide reliable sources of DNA. The aim of this study was to use fecal samples to evaluate the genetic variability of the Brazilian Pantanal population of pampas deer. Six heterologous microsatellite markers were used to screen 142 stool specimens. Seventy-four deer were identified, of which 50 adults were used to determine the genetic characteristics of the population. The Pantanal population showed high genetic diversity (mean number of alleles per locus = 11.5, expected heterozygosity = 0.75). This is the first investigation to characterize a South American deer species using fecal DNA and demonstrates the usefulness and efficiency of this approach, as well as the feasibility of obtaining information that could not have been easily obtained by traditional DNA sampling. Our findings suggest that management strategies for this species may be much more effective if applied now when the population still shows high genetic variability.

New records of Rickettsia bellii-infected ticks in Brazil / Novos relatos de carrapatos infectados por Rickettsia bellii no Brasil

This study investigated the occurrence of rickettsial infection in ticks collected from wild animals in two areas of Brazil. Amblyomma dubitatum ticks were collected from a capybara (Hydrochoerus hydrochaeris) in Guarda-Mor municipality, state of Minas Gerais, and Amblyomma pseudoconcolor ticks were collected from a six-banded armadillo (Euphractus sexcinctus) in Corumbá municipality, state of Mato Grosso do Sul. Attempts to isolate rickettsia in Vero cell culture were performed with one A. dubitatum tick and one A. pseudoconcolor tick, which were previously shown by the hemolymph test to contain Rickettsia-like structures within their hemocytes. Rickettsiae were successfully isolated in Vero cell culture from the two tick species. The two isolates were identified as Rickettsia bellii, since gltA partial sequences were 99.9%-100% identical to corresponding sequences of R. bellii in GenBank. While there have been several previous reports of R. bellii infecting A. dubitatum ticks, we provide the first report for A. pseudoconcolor, which increases to 25 the number of R. bellii-infected tick species in the American continent.(AU)

O presente trabalho investigou a ocorrência de infecção por Rickettsia em carrapatos coletados em animais selvagens de duas áreas do Brasil. Carrapatos da espécie Amblyomma dubitatum foram coletados de uma capivara (Hydrochoerus hydrochaeris) no município de Guarda-Mor, Minas Gerais, enquanto exemplares da espécie Amblyomma pseudoconcolor foram coletados de um tatu-peba (Euphractus sexcinctus) do município de Corumbá, Mato Grosso do Sul. Tentativas para isolar Rickettsia em cultura de células Vero foram realizadas com um exemplar de A. dubitatum e um de A. pseudoconcolor, que foram previamente positivos no teste de hemolinfa com estruturas semelhantes a Rickettsia visualizadas em seus hemócitos. Rickettsia foram isoladas com sucesso em culturas de células Vero a partir das duas espécies de carrapatos. Os dois isolados foram identificados como Rickettsia bellii, uma vez que suas sequências parciais do gene gltA foram 99,9-100%, idênticas a sequências de R. bellii do GenBank. Embora haja vários relatos anteriores de R. bellii infectando A. dubitatum, este é o primeiro relato em A. pseudoconcolor, aumentando para 25 o número de espécies de carrapatos infectadas por R. bellii no continente americano.(AU)

Occurrence of antibodies against Neospora caninum in wild pigs (Sus scrofa) in the Pantanal, Mato Grosso do Sul, Brazil / Ocorrência de anticorpos contra Neospora caninum em porcos-monteiro (Sus scrofa) do Pantanal, Mato Grosso do Sul, Brasil

Serum samples from 83 free living wild pigs (Sus scrofa) from the Nhecolândia region, Pantanal do Mato Grosso, Brazil, were examined for the presence of antibodies against Neospora caninum by means of the indirect fluorescence antibody test (IFAT) with a cut off of 50. Antibodies were present in 10.8%, with titers of: 1:200 in one animal, 1:400 in four and 1:800 in four. Analysis using the χ2 test showed an association between sex and presence of antibodies, with females showing occurrence of 20.5% and males 2.3% (p = 0.017). No association was found between age and occurrences of antibodies against this parasite. This was the first observation of N. caninum antibodies in Brazilian wild pigs from Pantanal...

Amostras de soro de 83 porcos-monteiro (Sus scrofa) selvagens, oriundos da região de Nhecolândia, Pantanal do Mato Grosso, Brasil, foram examinadas para a presença de anticorpos contra Neospora caninum pela reação de imunofluorescência indireta (RIFI) com ponto de corte de 50. A ocorrência de anticorpos foi de 10,8%, com um animal apresentando título de 1:200, quatro com 1:400 e quatro com 1:800. Quando analisados pelo teste do X2, foi observada a existência de associação entre sexo e presença de anticorpos, com as fêmeas apresentando ocorrência de 20,5% e os machos 2,3% (p = 0,017). Não houve associação entre idade e ocorrência de anticorpos contra este parasito. Esta é a primeira observação de porcos-monteiro da região do Pantanal, apresentando anticorpos contra N. caninum...

Complementary data on four methods for sampling free-living ticks in the Brazilian Pantanal / Dados complementares de quatro métodos para amostragem de carrapatos em vida livre no Pantanal brasileiro

In this study, four methods for sampling free-living ticks that are used in ecological and human tick-bite risk studies were evaluated. Cloth dragging, carbon dioxide traps and visual searches and inspection of plant litter on the ground were used in field and forest areas within the Brazilian Pantanal. Among the three tick species collected, Amblyomma sculptum predominated, followed by Amblyomma parvum and Amblyomma ovale. Dragging, a cheap and simple technique, yielded the highest numbers of ticks, particularly nymphs. The visual search detected a high number of adult ticks and provided information on tick questing height. Even though laborious, plant litter examination showed that large numbers of ticks may use this stratum. Carbon dioxide (CO2) traps are expensive and difficult to handle, but they are highly efficient for adult ticks, especially A. parvum. These data indicate that one method alone is incapable of providing a representative sample of the tick fauna in a particular area and that multiple techniques should be used for tick population studies.

Neste estudo, foram avaliados quatro métodos de amostragem de carrapatos em vida livre, usados em estudos ecológicos e avaliação do risco de picadas em humanos. Arraste de flanela, armadilhas de gás carbônico (CO2), busca visual e inspeção de serrapilheira foram aplicados em áreas campestres e florestais no Pantanal brasileiro. Dentre três espécies coletadas, a predominância foi de Amblyomma sculptum, seguida por Amblyomma parvum e Amblyomma ovale. O arraste, técnica simples e de baixo custo, resultou em maior número de carrapatos, particularmente de ninfas. A busca visual detectou alto número de carrapatos adultos e forneceu informações sobre altura de espera por hospedeiros. Apesar de trabalhoso, o exame da serrapilheira demonstrou que grande número de carrapatos pode utilizar esse estrato. Armadilhas de CO2 têm custo elevado e são difíceis de manusear, entretanto, são altamente eficientes para carrapatos adultos, em especial para A. parvum. Esses dados indicam que somente um método é incapaz de fornecer amostra representativa da ixodofauna em uma área particular e que, para estudos populacionais, técnicas múltiplas devem ser usadas.

Survey of Leptospira spp in pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) in the Pantanal wetlands of the state of Mato Grosso do Sul, Brazil by serology and polymerase chain reaction

This work reports a survey of Leptospira spp in pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) in the Pantanal wetlands of the state of Mato Grosso do Sul, Brazil by serology and polymerase chain reaction (PCR). Seventy pampas deer were captured in the dry season and surveyed using PCR, microscopic agglutination test (MAT) (n = 51) and by both techniques (n = 47). PCR detected infections in two pampas deer and MAT detected infections in three. Through sequencing and phylogenetic analyses, the PCR-amplified fragment detected in deer was identified as Leptospira interrogans. Serovars Pomona and Butembo were detected using MAT and the highest titre was 200 for serovar Pomona. Epidemiological aspects of the findings are discussed.

Aerial line transect survey to estimate abundance of marsh deer (Blastocerus dichotomus) (Illiger, 1815)

A população de cervo-do-pantanal (Blastocerus dichotomus) está drasticamente reduzida no Brasil. O nosso objetivo foi o de estimar a abundância do cervo-do-pantanal na bacia do Rio Paraná e discutir a metodologia aplicada. Os resultados darão suporte para uma análise do impacto do enchimento da represa de Porto Primavera sobre essa população. Sessenta e nove animais foram registrados através de sobrevôo utilizando-se a metodologia de transecção linear com amostragem das distâncias. Os dados não corrigidos resultaram em uma densidade estimada de 0,0035ind/ha e uma população de 636 indivíduos. A correção de g para os animais que não foram vistos apresentou uma densidade de 0,0049 ind/ha e uma abundância de 896 (CV=0,27) indivíduos. A metodologia foi aplicada com sucesso na estimativa de cervo-do-pantanal. Esse resultado é importante para avaliarmos a população do cervo-do-pantanal na área e para futuramente analisarmos o impacto do enchimento da represa.